MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 1130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207454
2	NC_017237	A	6	6	45	50	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
3	NC_017237	CTT	2	6	73	78	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207454
4	NC_017237	TTA	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207454
5	NC_017237	A	7	7	126	132	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
6	NC_017237	AT	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	384207454
7	NC_017237	GAT	2	6	192	197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207454
8	NC_017237	ATT	2	6	198	203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207454
9	NC_017237	A	6	6	223	228	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
10	NC_017237	A	6	6	242	247	100 %	0 %	0 %	0 %	384207454
11	NC_017237	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017237	CATA	2	8	293	300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017237	ATA	2	6	327	332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017237	ATTGA	2	10	363	372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017237	TA	3	6	400	405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017237	AAAT	2	8	443	450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017237	ATAG	2	8	462	469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017237	CTAA	2	8	488	495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017237	AATATA	2	12	500	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017237	ATT	2	6	524	529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017237	AAAT	2	8	546	553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017237	ATTT	2	8	601	608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017237	A	6	6	623	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017237	TAAA	2	8	645	652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017237	AT	3	6	662	667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017237	TATT	2	8	668	675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017237	A	7	7	707	713	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
28	NC_017237	TCA	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207455
29	NC_017237	A	6	6	779	784	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
30	NC_017237	TCT	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207455
31	NC_017237	ATT	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207455
32	NC_017237	AAT	2	6	915	920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207455
33	NC_017237	AT	4	8	1043	1050	50 %	50 %	0 %	0 %	384207455
34	NC_017237	A	6	6	1067	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
35	NC_017237	A	6	6	1078	1083	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
36	NC_017237	A	7	7	1096	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
37	NC_017237	GGA	2	6	1146	1151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207455
38	NC_017237	AGC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207455
39	NC_017237	TTC	2	6	1303	1308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207455
40	NC_017237	AG	3	6	1334	1339	50 %	0 %	50 %	0 %	384207455
41	NC_017237	A	8	8	1346	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	384207455
42	NC_017237	TTA	2	6	1379	1384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207455
43	NC_017237	T	9	9	1397	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017237	TAT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017237	TAAA	2	8	1426	1433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017237	ATC	2	6	1492	1497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017237	AGCTT	2	10	1522	1531	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017237	CTT	2	6	1542	1547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017237	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017237	AT	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017237	TTCT	2	8	1659	1666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017237	A	6	6	1683	1688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017237	TTA	2	6	1816	1821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017237	ATT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017237	A	6	6	1852	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017237	TAA	2	6	1858	1863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017237	AATA	2	8	1888	1895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017237	TAC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017237	TAT	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017237	AAAT	2	8	1978	1985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017237	AAT	2	6	2016	2021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017237	ATC	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017237	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017237	ATA	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017237	TAAA	2	8	2097	2104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017237	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017237	GCT	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017237	T	6	6	2143	2148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017237	A	6	6	2149	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017237	AAC	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017237	TAC	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017237	T	6	6	2271	2276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017237	ATA	2	6	2277	2282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017237	TAA	2	6	2292	2297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207456
75	NC_017237	A	6	6	2301	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	384207456
76	NC_017237	ATTT	2	8	2339	2346	25 %	75 %	0 %	0 %	384207456
77	NC_017237	ACT	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
78	NC_017237	ATC	2	6	2396	2401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
79	NC_017237	ATT	2	6	2508	2513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
80	NC_017237	T	6	6	2518	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
81	NC_017237	ATT	2	6	2525	2530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
82	NC_017237	AAT	2	6	2558	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207456
83	NC_017237	TTG	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207456
84	NC_017237	TCA	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
85	NC_017237	CAA	2	6	2602	2607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207456
86	NC_017237	T	6	6	2670	2675	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
87	NC_017237	TAT	2	6	2717	2722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
88	NC_017237	ATCA	2	8	2783	2790	50 %	25 %	0 %	25 %	384207456
89	NC_017237	TAA	2	6	2803	2808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207456
90	NC_017237	ATC	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
91	NC_017237	TAG	2	6	2851	2856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207456
92	NC_017237	TTA	2	6	2917	2922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
93	NC_017237	CAG	2	6	3019	3024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207456
94	NC_017237	AAC	2	6	3039	3044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207456
95	NC_017237	A	6	6	3101	3106	100 %	0 %	0 %	0 %	384207456
96	NC_017237	CTA	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
97	NC_017237	GTA	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207456
98	NC_017237	CAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
99	NC_017237	CAAAA	2	10	3184	3193	80 %	0 %	0 %	20 %	384207456
100	NC_017237	CTTC	2	8	3267	3274	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
101	NC_017237	TCT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207456
102	NC_017237	TTG	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207456
103	NC_017237	CAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207456
104	NC_017237	ATTT	2	8	3437	3444	25 %	75 %	0 %	0 %	384207456
105	NC_017237	TTA	2	6	3465	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
106	NC_017237	ATC	2	6	3545	3550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207456
107	NC_017237	CA	3	6	3593	3598	50 %	0 %	0 %	50 %	384207456
108	NC_017237	A	8	8	3611	3618	100 %	0 %	0 %	0 %	384207456
109	NC_017237	T	7	7	3631	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
110	NC_017237	ATT	2	6	3641	3646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
111	NC_017237	AAGAA	2	10	3758	3767	80 %	0 %	20 %	0 %	384207456
112	NC_017237	CT	3	6	3768	3773	0 %	50 %	0 %	50 %	384207456
113	NC_017237	ATATGT	2	12	3774	3785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384207456
114	NC_017237	T	6	6	3832	3837	0 %	100 %	0 %	0 %	384207456
115	NC_017237	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207456
116	NC_017237	TAAA	2	8	3925	3932	75 %	25 %	0 %	0 %	384207456
117	NC_017237	A	6	6	3953	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017237	AT	5	10	3990	3999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017237	TAT	3	9	3997	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017237	AT	3	6	4009	4014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017237	TTA	2	6	4027	4032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017237	TACA	2	8	4054	4061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017237	T	6	6	4074	4079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017237	AGA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017237	ATA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017237	A	6	6	4280	4285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017237	TAA	2	6	4341	4346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017237	AACA	2	8	4361	4368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017237	ATG	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017237	TAA	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017237	TTA	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017237	AGA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017237	AATCTC	2	12	4498	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017237	AAT	2	6	4531	4536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
135	NC_017237	ATA	2	6	4586	4591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
136	NC_017237	TTTA	2	8	4603	4610	25 %	75 %	0 %	0 %	384207457
137	NC_017237	AAT	2	6	4611	4616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
138	NC_017237	TAT	2	6	4626	4631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
139	NC_017237	CTA	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207457
140	NC_017237	TAA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
141	NC_017237	GTT	2	6	4700	4705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207457
142	NC_017237	TAA	2	6	4762	4767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207457
143	NC_017237	T	8	8	4778	4785	0 %	100 %	0 %	0 %	384207457
144	NC_017237	AGCA	2	8	4786	4793	50 %	0 %	25 %	25 %	384207457
145	NC_017237	ATT	2	6	4802	4807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
146	NC_017237	ATT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207457
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